Upgrading Lustre

It’s been close to a year since I updated our cluster; I was going to do it over Christmas, but never quite got around to it. The period of social distancing (and procrastinating on my research) is a great time, right? The cluster is running Centos 7. The biggest issue with upgrading it is the Lustre file system. These are all my notes on the upgrade process. I’m hoping by writing them down here, my life will be somewhat easier the next time I need to do this. Learning how Lustre works all over again every time I do an update is an involved process!

Lustre is very picky about the version of the Linux kernel. This means we can’t just do a blanket “sudo yum update” on the system. We need to upgrade to the specific kernel version that is required by the new version of Lustre we will be installing.

On wyeast, the Lustre server is installed across three different nodes: wyeast-lustre01, wyeast-lustre02, and wyeast-lustre03. The metadata server is on the first node, and the object storage targets are stored on lustre02 and lustre03.

First, update the list of updates that yum knows about:

sudo yum makecache

Next, look at the lustre-server repo and find the current version of the Lustre server and the Linux kernel it uses.

sudo yum repo-pkgs lustre-server list

From this, I found that the current Lustre server version is 2.12.4. I checked the changelog on lustre.org to determine the kernel version needed:

http://wiki.lustre.org/Lustre_2.12.4_Changelog

The Linux kernel needed is actually available in the Lustre-server repo:

kernel-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre

So I needed to make sure to install that particular version and not the most up-to-date kernel.

sudo yum repo-pkgs lustre-server update kernel-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre kernel-devel-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre kernel-headers-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre

After that, I checked the current list of other updates available in the Lustre server repository.

sudo yum repo-pkgs lustre-server list

Next, I updated all the Lustre packages that were already installed:

sudo yum repo-pkgs lustre-server update kmod-lustre.x86_64 kmod-lustre-osd-ldiskfs.x86_64 libnvpair1.x86_64 libuutil1.x86_64 libzfs2.x86_64 libzpool2.x86_64 lustre.x86_64 lustre-osd-ldiskfs-mount.x86_64 lustre-osd-zfs-mount.x86_64 lustre-resource-agents.x86_64 lustre-zfs-dkms.noarch spl.x86_64 spl-dkms.noarch zfs.x86_64 zfs-dkms.noarch

Finally, I’ll update all the other system software, carefully excluding the Linux kernel packages:

sudo yum -x kernel,kernel-headers,kernel-debug-devel,kernel-tools,kernel-tools-libs,kmod-lustre.x86_64,kmod-lustre-osd-ldiskfs.x86_64,libnvpair1.x86_64,libuutil1.x86_64,libzfs2.x86_64,libzpool2.x86_64,lustre.x86_64,lustre-osd-ldiskfs-mount.x86_64,lustre-osd-zfs-mount.x86_64,lustre-resource-agents.x86_64,lustre-zfs-dkms.noarch,spl.x86_64,spl-dkms.noarch,spl-dkms.noarch,zfs.x86_64,zfs-dkms.noarch,kernel-devel update

That completes all the software upgrades. The same process needs to be done on wyeast-lustre02 and wyeast-lustre03. I probably should have umounted Lustre mounts before this process, but I didn’t. So after the reboot, Lustre wasn’t quite working. I had to fix it.

First, I had to fix the firewall again on the Lustre machines:

sudo iptables -F

Next, zfs (the file system used by Lustre) was messed up on wyeast-lustre01 and wyeast-lustre02.

The command:

zfs list

wasn’t working. It showed that zfs wasn’t loaded. So the first step is to do:

modprobe zfs

This loaded zfs. However, our zfs pools are missing. This command fixed that:

zpool import

This finds the zpools and allows them to be imported:

zpool import lustre-ost0/ost0

zpool import lustre-ost0/ost0

This loads the zfs pools, but I still need to remount the Lustre file system. This needs to be done on the object storage targets first (lustre02 and lustre03) before it is done on the metadata server (lustre01).

sudo mount -t lustre lustre-ost0/ost0 /lustre-ost0/ost0

sudo mount -t lustre lustre-ost1/ost1 /lustre-ost1/ost1

Lustre actually automounted correctly on Lustre03, so I didn’t have to fix anything. With the targets working, it was time to fix Lustre01:

mount -t lustre lustre-mgsmdt/mgsmdt /lustre-mgsmdt/mgsmdt

Mounting the Lustre file system starts the Lustre service and we are off to the races.

Back on the compute nodes, it wasn’t finding the Lustre mount on the head node. So I had to unmount and then remount Lustre.

First, when I tried to unmount Lustre, the file system was reported as busy. So I ran the following command the find the guilty processes:

sudo lsof +f -- /lustre

This gives me a list of processes that I was then able to kill off. After that:

sudo umount /lustre

Followed by:

sudo mount -t lustre 192.168.1.11@tcp:/lustre /lustre

Which worked! Although I hadn’t yet updated the Lustre client, it was still able to handle the updated Lustre server. The other nodes that didn’t have active shells attached to them didn’t have any trouble with the change; I didn’t even have to remount them; the file system just showed up without any trouble.

Next step is to update the software on the compute nodes. Similar process except somewhat easier since we don’t have to deal with zfs. I still want to limit the install to the particular Linux kernel and the “Lustre-client” repo. In this case, I had to download the rpms from rpmfind:

https://rpmfind.net/linux/rpm2html/search.php?query=kernel%28×86-64%29&submit=Search+…&system=&arch=

I downloaded RPMs for kernel, kernel-debug-devel, kernel-headers, kernel-tools, and kernel-tools-libs. This time, I remembered to unmount /lustre first. Then I installed the new kernel modules:

Then, to install them:

sudo yum localinstall kernel-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-debug-devel-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-headers-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-tools-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-tools-libs-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm

Next, update the Lustre client:

sudo yum repo-pkgs lustre-client update kmod-lustre-client.x86_64 lustre-client.x86_64

Then update everything else, excluding the kernel stuff:

sudo yum update -x kernel,kernel-debug-devel,kernel-headers,kernel-tools,kernel-tools-libs

Finally, reboot and then remount Lustre:

sudo mount -t lustre 192.168.1.11@tcp:/lustre /lustre

Unlike with the Lustre server, I didn’t encounter any trouble with the reboot. The Lustre partition survived the update just fine, and I was able to successfully update all the rest of the installed software on the system.

0 thoughts on “Upgrading Lustre

  1. Вебкам студия – это уникальное и инновационное место, где профессиональные модели и артисты могут транслировать свои выступления или шоу в режиме реального времени через интернет. Этот тип деятельности становится все более модным, привлекая внимание как самых азартных зрителей, так и тех, кто ищет новые и достойные внимания форматы веселий.

    Вебкам студии предоставляют платформу для проведения онлайн-выступлений разного нрава: от эротических гала-шоу до музыкальных выступлений, обучающих курсов или творческих показов. Это отличный способ для артистов и моделей показать свои таланты и получить дополнительный доход.

    Одним из ключевых преимуществ [url=https://otsovik.com/job/moskva/malenaonline/]https://otsovik.com/job/moskva/malenaonline/[/url] веб-камера студий является возможность работать из любой точки мира, где есть выход в интернет. Это раскрывает перед артистами и моделями широкие горизонты и позволяет им расширить свою аудиторию за счет зрителей из разных государств.

    Кроме того, веб-камера студии обеспечивают безопасное и конфиденциальное взаимодействие меж артистами и созерцателями. Платформы как обычно предоставляют надежные системы шифрования данных и возможность устанавливать разные уровни приватности для контента.

    Для тех, кто хочет начать работать в веб-камера студии, принципиально выбрать надежное и проф место, в каком месте можно развивать свои таланты и навыки. На таких платформах часто предоставляются обучающие курсы, консультации и поддержка специалистов.

    Поэтому, веб-камера студии – это инновационный формат развлечений и работы, который предоставляет огромное количество возможностей для развития продвижении по службе артистов и моделей. Современные технологические процессы делают этот тип деятельности легкодоступным и удобным, что дает возможность каждому найти свое место в этой увлекательной и динамично развивающейся сфере.

  2. Вебкам студия – это уникальное и инновационное место, где проф модели и артисты могут транслировать свои выступления или гала-шоу в режиме онлайн через интернет. данный тип деятельности становится все более известным, привлекая внимание как самых азартных зрителей, так и тех, кто ищет новые и интересные форматы веселий.

    Вебкам студии предоставляют платформу для проведения онлайн-выступлений различного характера: от эротических гала-шоу до музыкальных выступлений, обучающих курсов или творческих показов. Это отличный способ для артистов и моделей показать свои таланты и получить дополнительный доход.

    Одним из ключевых превосходств [url=https://erbp.ru/companies/32527]https://erbp.ru/companies/32527[/url] вебкам студий является возможность работать из любой точки мира, где есть выход в интернет. Это открывает перед артистами и моделями широкие горизонты и позволяет им расширить свою аудиторию за счет созерцателей из разных государств.

    Кроме того, вебкам студии дают обеспечение неопасное и конфиденциальное взаимодействие между артистами и зрителями. Платформы обычно предоставляют надежные системы шифрования данных и возможность устанавливать различные уровни приватности для контента.

    Тем, кто хочет начать работать в веб-камера студии, принципиально выбрать надежное и проф место, где можно развивать свои таланты и навыки. На таких платформах часто предоставляются обучающие курсы, консультации и поддержка специалистов.

    Таким образом, вебкам студии – это инновационный формат веселий и работы, который предоставляет огромное количество возможностей для развития карьеры артистов и моделей. Современные технологии делают этот тип деятельности доступным и удобным, что дает возможность каждому отыскать свое место в этой увлекательной и динамично развивающейся сфере.

  3. Вебкам студия – это уникальное и инновационное место, где профессиональные модели и артисты могут транслировать свои выступления либо гала-шоу в режиме реального времени через веб. Этот тип деятельности становится все более известным, привлекая внимание как самых азартных зрителей, так и тех, кто ищет новые и интересные форматы развлечений.

    Вебкам студии предоставляют платформу для проведения онлайн-выступлений различного нрава: от эротических гала-шоу до музыкальных выступлений, обучающих курсов либо творческих показов. Это отличный способ для артистов и моделей показать свои таланты и получить дополнительный доход.

    Одним из главных превосходств [url=http://veloyarsk.ru/infusions/pages/osvezghite_svoy_onlayn_performans.html]http://veloyarsk.ru/infusions/pages/osvezghite_svoy_onlayn_performans.html[/url] веб-камера студий является возможность работать из любой точки мира, где есть доступ к интернету. Это открывает перед артистами и моделями широкие горизонты и позволяет им расширить свою аудиторию посредством зрителей из разных государств.

    Кроме того, вебкам студии дают обеспечение безопасное и конфиденциальное взаимодействие меж артистами и зрителями. Платформы как обычно предоставляют надежные системы шифрования данных и возможность устанавливать разные уровни приватности для контента.

    Тем, кто хочет начать работать в вебкам студии, важно избрать надежное и профессиональное место, в каком месте можно развивать свои таланты и навыки. На таких платформах часто предоставляются обучающие курсы, консультации и поддержка специалистов.

    Таким образом, вебкам студии – это инновационный формат развлечений и работы, который предоставляет огромное количество возможностей для развития карьеры артистов и моделей. Современные технологии делают этот тип деятельности легкодоступным и удобным, что позволяет каждому отыскать свое место в этой увлекательной и динамично развивающейся сфере.

  4. Вебкам студия – это уникальное и инновационное место, где профессиональные модели и артисты могут транслировать свои выступления либо шоу в режиме онлайн через веб. Этот тип деятельности становится все более популярным, привлекая внимание как самых азартных зрителей, так и тех, кто ищет новые и достойные внимания форматы развлечений.

    Вебкам студии предоставляют платформу для проведения онлайн-выступлений различного нрава: от эротических гала-шоу до музыкальных выступлений, обучающих курсов либо творческих показов. Это отличный способ для артистов и моделей показать свои таланты и получить дополнительный доход.

    Одним из главных превосходств [url=https://volgateks21.ru/basket/pgs/?vebkam_industriya__sekretu_uspeha_dlya_par.html]https://volgateks21.ru/basket/pgs/?vebkam_industriya__sekretu_uspeha_dlya_par.html[/url] вебкам студий является возможность работать из любой точки мира, где есть выход в интернет. Это раскрывает перед артистами и моделями широкие горизонты и позволяет им расширить свою аудиторию посредством зрителей из разных стран.

    Кроме того, веб-камера студии дают обеспечение неопасное и конфиденциальное взаимодействие меж артистами и зрителями. Платформы как обычно предоставляют надежные системы шифрования данных и возможность устанавливать различные уровни приватности для контента.

    Для тех, кто желает начать работать в веб-камера студии, принципиально избрать надежное и проф место, в каком месте можно развивать свои таланты и навыки. На таких платформах часто предоставляются обучающие курсы, консультации и поддержка специалистов.

    Таким образом, веб-камера студии – это инновационный формат веселий и работы, который предоставляет множество возможностей для развития продвижении по службе артистов и моделей. Современные технологии делают этот тип деятельности легкодоступным и удобным, что позволяет каждому отыскать свое место в этой увлекательной и оживленно развивающейся сфере.

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *