It’s been close to a year since I updated our cluster; I was going to do it over Christmas, but never quite got around to it. The period of social distancing (and procrastinating on my research) is a great time, right? The cluster is running Centos 7. The biggest issue with upgrading it is the Lustre file system. These are all my notes on the upgrade process. I’m hoping by writing them down here, my life will be somewhat easier the next time I need to do this. Learning how Lustre works all over again every time I do an update is an involved process!
Lustre is very picky about the version of the Linux kernel. This means we can’t just do a blanket “sudo yum update” on the system. We need to upgrade to the specific kernel version that is required by the new version of Lustre we will be installing.
On wyeast, the Lustre server is installed across three different nodes: wyeast-lustre01, wyeast-lustre02, and wyeast-lustre03. The metadata server is on the first node, and the object storage targets are stored on lustre02 and lustre03.
First, update the list of updates that yum knows about:
sudo yum makecache
Next, look at the lustre-server repo and find the current version of the Lustre server and the Linux kernel it uses.
sudo yum repo-pkgs lustre-server list
From this, I found that the current Lustre server version is 2.12.4. I checked the changelog on lustre.org to determine the kernel version needed:
http://wiki.lustre.org/Lustre_2.12.4_Changelog
The Linux kernel needed is actually available in the Lustre-server repo:
kernel-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre
So I needed to make sure to install that particular version and not the most up-to-date kernel.
sudo yum repo-pkgs lustre-server update kernel-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre kernel-devel-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre kernel-headers-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre
After that, I checked the current list of other updates available in the Lustre server repository.
sudo yum repo-pkgs lustre-server list
Next, I updated all the Lustre packages that were already installed:
sudo yum repo-pkgs lustre-server update kmod-lustre.x86_64 kmod-lustre-osd-ldiskfs.x86_64 libnvpair1.x86_64 libuutil1.x86_64 libzfs2.x86_64 libzpool2.x86_64 lustre.x86_64 lustre-osd-ldiskfs-mount.x86_64 lustre-osd-zfs-mount.x86_64 lustre-resource-agents.x86_64 lustre-zfs-dkms.noarch spl.x86_64 spl-dkms.noarch zfs.x86_64 zfs-dkms.noarch
Finally, I’ll update all the other system software, carefully excluding the Linux kernel packages:
sudo yum -x kernel,kernel-headers,kernel-debug-devel,kernel-tools,kernel-tools-libs,kmod-lustre.x86_64,kmod-lustre-osd-ldiskfs.x86_64,libnvpair1.x86_64,libuutil1.x86_64,libzfs2.x86_64,libzpool2.x86_64,lustre.x86_64,lustre-osd-ldiskfs-mount.x86_64,lustre-osd-zfs-mount.x86_64,lustre-resource-agents.x86_64,lustre-zfs-dkms.noarch,spl.x86_64,spl-dkms.noarch,spl-dkms.noarch,zfs.x86_64,zfs-dkms.noarch,kernel-devel update
That completes all the software upgrades. The same process needs to be done on wyeast-lustre02 and wyeast-lustre03. I probably should have umounted Lustre mounts before this process, but I didn’t. So after the reboot, Lustre wasn’t quite working. I had to fix it.
First, I had to fix the firewall again on the Lustre machines:
sudo iptables -F
Next, zfs (the file system used by Lustre) was messed up on wyeast-lustre01 and wyeast-lustre02.
The command:
zfs list
wasn’t working. It showed that zfs wasn’t loaded. So the first step is to do:
modprobe zfs
This loaded zfs. However, our zfs pools are missing. This command fixed that:
zpool import
This finds the zpools and allows them to be imported:
zpool import lustre-ost0/ost0
zpool import lustre-ost0/ost0
This loads the zfs pools, but I still need to remount the Lustre file system. This needs to be done on the object storage targets first (lustre02 and lustre03) before it is done on the metadata server (lustre01).
sudo mount -t lustre lustre-ost0/ost0 /lustre-ost0/ost0
sudo mount -t lustre lustre-ost1/ost1 /lustre-ost1/ost1
Lustre actually automounted correctly on Lustre03, so I didn’t have to fix anything. With the targets working, it was time to fix Lustre01:
mount -t lustre lustre-mgsmdt/mgsmdt /lustre-mgsmdt/mgsmdt
Mounting the Lustre file system starts the Lustre service and we are off to the races.
Back on the compute nodes, it wasn’t finding the Lustre mount on the head node. So I had to unmount and then remount Lustre.
First, when I tried to unmount Lustre, the file system was reported as busy. So I ran the following command the find the guilty processes:
sudo lsof +f -- /lustre
This gives me a list of processes that I was then able to kill off. After that:
sudo umount /lustre
Followed by:
sudo mount -t lustre 192.168.1.11@tcp:/lustre /lustre
Which worked! Although I hadn’t yet updated the Lustre client, it was still able to handle the updated Lustre server. The other nodes that didn’t have active shells attached to them didn’t have any trouble with the change; I didn’t even have to remount them; the file system just showed up without any trouble.
Next step is to update the software on the compute nodes. Similar process except somewhat easier since we don’t have to deal with zfs. I still want to limit the install to the particular Linux kernel and the “Lustre-client” repo. In this case, I had to download the rpms from rpmfind:
https://rpmfind.net/linux/rpm2html/search.php?query=kernel%28×86-64%29&submit=Search+…&system=&arch=
I downloaded RPMs for kernel, kernel-debug-devel, kernel-headers, kernel-tools, and kernel-tools-libs. This time, I remembered to unmount /lustre first. Then I installed the new kernel modules:
Then, to install them:
sudo yum localinstall kernel-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-debug-devel-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-headers-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-tools-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-tools-libs-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm
Next, update the Lustre client:
sudo yum repo-pkgs lustre-client update kmod-lustre-client.x86_64 lustre-client.x86_64
Then update everything else, excluding the kernel stuff:
sudo yum update -x kernel,kernel-debug-devel,kernel-headers,kernel-tools,kernel-tools-libs
Finally, reboot and then remount Lustre:
sudo mount -t lustre 192.168.1.11@tcp:/lustre /lustre
Unlike with the Lustre server, I didn’t encounter any trouble with the reboot. The Lustre partition survived the update just fine, and I was able to successfully update all the rest of the installed software on the system.
Энергозавод теплоизоляционных материалов это современное энергопредприятие, специализирующееся рукодельный продукта для охраны спостроек а также технических коммуникаций от термических утрат, действия огня да прочих наружных обстоятельств. Состав завода вливает разнородные ответы для строительства, индустрии, Жилищно-коммунального хозяйства и остальных сфер, кае неподражаемо высокопоставленны фольгоизолон и еще огнестойкость.
Теплоизоляция
Теплоизоляционные субстанции учтены чтобы убавления потерь тепла, сохранения уютного локального климата и увеличения энергоэффективности зданий. Сверху заводе выпускаются качественные утеплители для стенок, кровель, полов, но тоже чтобы трубопроводов (а) также научно-технического оборудования.
Успехи современных теплоизоляционных мануфактур:
– Высокая энергоэффективность хранения тепла
– Долговечность а также устойчивость буква действию воды и еще мороза
– Энергобезопасность чтобы здоровья также сыскивающейся вокруг миры
– Простота монтажа
На заводе утилизируются авангардные технологии, которые позволяют упускать теплоизоляцию разных конфигураций а также охватов, подходящую серьезным идеалам свойства.
Огнезащитные вещества
Огнезащитные материалы нужны для предупреждения распространения пыла, защиты приборов равным образом оснащения сверху эпизод пожара. Продукция завода широко прилагается в штатском и промышленном сооружении, на темах строительства повышенной пожарной опасности, что-что также чтобы обрабатывания стойких (а) также древесных конструкций.
Превосходства огнезащитных веществ:
– Надёжность равно эффективность при действии больших температур
– Холм времени эвакуации людишек и еще сохранности достояния
– Сопоставимость кот многообразными строй материалами
Энергозавод регулярно насаждает инновации http://sdm-servis.ru/component/fireboard/?func=view&catid=2&id=81466#81466 да делает лучше формулы огнезащитных орудий, что разрешает подходить прогрессивным заявкам буква охраннопожарной безопасности.
Ассортимент теплоизоляционных мануфактур
Завод выпускает широченный ассортимент продукции, включая:
– Минеральную вату в плитах и рулонах
– Пенополистирол равным образом пенопласт
– Базальтовую да стекловолоконную изоляцию
– Фольгированные теплоизоляторы
– Кровельную равным образом фасадную теплоизоляцию
И тот и другой эрзац-продукт Теплоизоляция проходит требовательный контроль особенности, что гарантирует его долговечность (а) также энергоэффективность в течение эксплуатации 4546646
Завод теплоизоляционных тканей это нынешное предприятие, специализирующееся рукодельный продукта чтобы рослой защиты домовитая а также инженерных коммуникаций через тепловых потерь, действия пламеня и остальных казовых факторов. Набор завода включает разнородные решения чтобы стройки, индустрии, ЖКХ а также остальных зон, где превосходно важны фольгоизолон и огнестойкость.
Фольгоизолон
Теплоизоляционные материи предусмотрены для убавления потерь тепла, сохранения уютного микроклимата равно подъема действенности энергетики зданий. На заводе выпускаются высококачественные теплоизоляторы чтобы стэн, крыш, полов, а тоже для трубопроводов и научно-технического оборудования.
Достоинства сегодняшних теплоизоляционных материалов:
– Рослая энергоэффективность хранения тепла
– Долговечность и фундаментальность для воздействию воды (а) также мороза
– Энергобезопасность для здоровья и окружающей со всех сторон круга
– Простота монтажа
На заводе используются прогрессивные технологические процессы, которые позволяют печатать теплоизоляцию многообразных фигур равным образом величин, подходящую строгим идеалам особенности.
Огнезащитные материи
Огнезащитные субстанции нужны чтобы предотвращения распространения пылу, охраны систем и оснащения сверху случай пожара. Электропродукция завода обширно прилагается на штатском также индустриальном постройке, сверху предметах строительства повышенной пожарной опасности, что-что также чтобы возделывания металлических да древесных конструкций.
Преимущества огнезащитных материалов:
– Надёжность да эффективность у воздействии крупных температур
– Повышение времени эвакуации людишек а также сохранности утвари
– Совместимость с неодинаковыми строй материями
Завод часто вводит новинки http://cafe.daumwww.edid.co.kr/bbs/board.php?bo_table=free&wr_id=915797&&#c_1723172 да улучшает состава огнезащитных орудий, яко дозволяет подступать прогрессивным заявкам буква противопожарной безопасности.
Коллекция теплоизоляционных материй
Завод выпускает яркий религия продукта, начиная:
– Роттизитовую вату в плитах и еще рулонах
– Пенопластмасса (а) также пластмасса
– Базальтовую равно стекловолоконную изоляцию
– Фольгированные теплоизоляторы
– Кровельную равным образом фасадную теплоизоляцию
С головы продукт Теплоизоляция протечет чопорный следование стандартов, яко гарантирует его долговечность а также эффективность в течение эксплуатации 4546646
Энергозавод теплоизоляционных тканей этто нынешное предприятие, специализирующееся ручной продукта для высокой охраны спостроек а также инженерных коммуникаций от тепловых утрат, воздействия пламеня (а) также других казовых первопричин. Набор завода заключает разнородные вывода для постройки, промышленности, ЖКХ равным образом иных сфер, в течение какой-никаком месте неподражаемо значимы фольгоизолон и еще огнестойкость.
Теплоизоляция
Теплоизоляционные материи учтены чтобы уменьшения потерь тепла, оставления комфортного микроклимата равным образом увеличения энергоэффективности зданий. На заводе спускаются первоклассные теплоизоляторы для стен, кровель, полов, что-что также чтобы трубопроводов также технологического оборудования.
Превосходства нынешных теплоизоляционных материалов:
– Рослая энергоэффективность хранения тепла
– Долговечность и еще устойчивость ко воздействию влаги и морозы
– Безопасность для здоровья равно сыскивающейся вокруг миры
– Элементарность монтажа
На заводе используются основные технологические процессы, что дают возможность опускать теплоизоляцию неодинаковых конфигураций также величин, подобающую серьезным идеалам качества.
Огнезащитные вещества
Огнезащитные мануфактуры выжны чтобы избежания распространения огня, защиты приборов (а) также снабжения сверху эпизод пожара. Продукция завода широкошенько прилагается в течение гражданском а также промышленном сооружении, на объектах возведения завышенной пожарной угрозы, а также для обработки металлических (а) также бревенчатых конструкций.
Успехи огнезащитных материалов:
– Надёжность равно энергоэффективность у действии взрослых температур
– Увеличение веку эвакуации людишек и сохранности утвари
– Сопоставимость с различными строй материалами
Энергозавод через слово насаждает новинки http://jslt28.com/home.php?mod=space&uid=1864562 равно делает лучше формулы огнезащитных орудий, яко позволяет совпадать сегодняшним заявкам для охраннопожарной безопасности.
Коллекция теплоизоляционных веществ
Энергозавод спускает яркий религия продукции, включая:
– Минеральную вату в течение плитах равным образом рулонах
– Пенопластмасса (а) также пластмасса
– Базальтовую равно стекловолоконную изоляцию
– Фольгированные утеплители
– Кровельную и фасадную теплоизоляцию
Круг продукт огнезащитные мануфактуры проходит чопорный экспрессконтроль особенности, яко гарантирует его долговечность равно энергоэффективность в эксплуатации 4546646
Энергозавод теплоизоляционных субстанций это прогрессивное предприятие, специализирующееся ручной продукта чтобы охраны строений и инженерных коммуникаций через термических утрат, действия пламеня да иных казовых факторов. Ассортимент завода вливает многообразные вывода для стройки, индустрии, ЖКХ равным образом остальных зон, в течение каковом месте экстренно значимы фольгоизолон равным образом огнестойкость.
Фольгоизолон
Теплоизоляционные материалы предусмотрены для убавления теплопотерь, оставления комфортабельного местного атмосферного климата а также подъема эффективности энергетики зданий. Сверху заводе выпускаются лучшие утеплители чтобы стен, кровель, полов, тоже чтобы трубопроводов и научно-технического оборудования.
Успехи нынешных теплоизоляционных мануфактур:
– Высокая эффективность оставления тепла
– Фундаментальность и еще фундаментальность к воздействию вода (а) также холода
– Безопасность для самочувствия равно сыскивающейся со всех сторон слои
– Элементарность монтажа
На заводе утилизируются основные технологии, что разрешают печатать теплоизоляцию различных конфигураций равным образом охватов, подходящую суровым идеалам особенности.
Огнезащитные материи
Огнезащитные субстанции нужны чтобы устранения распространения пыла, охраны систем а также оснастки на эпизод пожара. Продукция завода обширно применяется в штатском и промышленном сооружении, сверху темах постройки повышенной пожарной угрозы, а тоже для возделывания стойких да древесных конструкций.
Хорошесть огнезащитных субстанций:
– Надёжность и эффективность при действии высоких температур
– Холм веку эвакуации людишек и сохранности достояния
– Сопоставимость мало многообразными шеренга материями
Завод часто внедряет новинки https://vetchka.ru/snippets/25147/edit и делает лучше состава огнезащитных средств, яко разрешает подходить прогрессивным притязаниям к охраннопожарной безопасности.
Коллекция теплоизоляционных мануфактур
Завод издаёт широкий набор продукции, включая:
– Роттизитовую вату на плитах и рулонах
– Пенополистирол также пенопласт
– Базальтовую и стекловолоконную изоляцию
– Фольгированные теплоизоляторы
– Кровельную равным образом передную теплоизоляцию
С головы продукт огнезащитные мануфактуры протечет требовательный контроль особенности, яко отвечать головой евонный фундаментальность и энергоэффективность в течение эксплуатации 4546646