It’s been close to a year since I updated our cluster; I was going to do it over Christmas, but never quite got around to it. The period of social distancing (and procrastinating on my research) is a great time, right? The cluster is running Centos 7. The biggest issue with upgrading it is the Lustre file system. These are all my notes on the upgrade process. I’m hoping by writing them down here, my life will be somewhat easier the next time I need to do this. Learning how Lustre works all over again every time I do an update is an involved process!
Lustre is very picky about the version of the Linux kernel. This means we can’t just do a blanket “sudo yum update” on the system. We need to upgrade to the specific kernel version that is required by the new version of Lustre we will be installing.
On wyeast, the Lustre server is installed across three different nodes: wyeast-lustre01, wyeast-lustre02, and wyeast-lustre03. The metadata server is on the first node, and the object storage targets are stored on lustre02 and lustre03.
First, update the list of updates that yum knows about:
sudo yum makecache
Next, look at the lustre-server repo and find the current version of the Lustre server and the Linux kernel it uses.
sudo yum repo-pkgs lustre-server list
From this, I found that the current Lustre server version is 2.12.4. I checked the changelog on lustre.org to determine the kernel version needed:
http://wiki.lustre.org/Lustre_2.12.4_Changelog
The Linux kernel needed is actually available in the Lustre-server repo:
kernel-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre
So I needed to make sure to install that particular version and not the most up-to-date kernel.
sudo yum repo-pkgs lustre-server update kernel-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre kernel-devel-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre kernel-headers-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre
After that, I checked the current list of other updates available in the Lustre server repository.
sudo yum repo-pkgs lustre-server list
Next, I updated all the Lustre packages that were already installed:
sudo yum repo-pkgs lustre-server update kmod-lustre.x86_64 kmod-lustre-osd-ldiskfs.x86_64 libnvpair1.x86_64 libuutil1.x86_64 libzfs2.x86_64 libzpool2.x86_64 lustre.x86_64 lustre-osd-ldiskfs-mount.x86_64 lustre-osd-zfs-mount.x86_64 lustre-resource-agents.x86_64 lustre-zfs-dkms.noarch spl.x86_64 spl-dkms.noarch zfs.x86_64 zfs-dkms.noarch
Finally, I’ll update all the other system software, carefully excluding the Linux kernel packages:
sudo yum -x kernel,kernel-headers,kernel-debug-devel,kernel-tools,kernel-tools-libs,kmod-lustre.x86_64,kmod-lustre-osd-ldiskfs.x86_64,libnvpair1.x86_64,libuutil1.x86_64,libzfs2.x86_64,libzpool2.x86_64,lustre.x86_64,lustre-osd-ldiskfs-mount.x86_64,lustre-osd-zfs-mount.x86_64,lustre-resource-agents.x86_64,lustre-zfs-dkms.noarch,spl.x86_64,spl-dkms.noarch,spl-dkms.noarch,zfs.x86_64,zfs-dkms.noarch,kernel-devel update
That completes all the software upgrades. The same process needs to be done on wyeast-lustre02 and wyeast-lustre03. I probably should have umounted Lustre mounts before this process, but I didn’t. So after the reboot, Lustre wasn’t quite working. I had to fix it.
First, I had to fix the firewall again on the Lustre machines:
sudo iptables -F
Next, zfs (the file system used by Lustre) was messed up on wyeast-lustre01 and wyeast-lustre02.
The command:
zfs list
wasn’t working. It showed that zfs wasn’t loaded. So the first step is to do:
modprobe zfs
This loaded zfs. However, our zfs pools are missing. This command fixed that:
zpool import
This finds the zpools and allows them to be imported:
zpool import lustre-ost0/ost0
zpool import lustre-ost0/ost0
This loads the zfs pools, but I still need to remount the Lustre file system. This needs to be done on the object storage targets first (lustre02 and lustre03) before it is done on the metadata server (lustre01).
sudo mount -t lustre lustre-ost0/ost0 /lustre-ost0/ost0
sudo mount -t lustre lustre-ost1/ost1 /lustre-ost1/ost1
Lustre actually automounted correctly on Lustre03, so I didn’t have to fix anything. With the targets working, it was time to fix Lustre01:
mount -t lustre lustre-mgsmdt/mgsmdt /lustre-mgsmdt/mgsmdt
Mounting the Lustre file system starts the Lustre service and we are off to the races.
Back on the compute nodes, it wasn’t finding the Lustre mount on the head node. So I had to unmount and then remount Lustre.
First, when I tried to unmount Lustre, the file system was reported as busy. So I ran the following command the find the guilty processes:
sudo lsof +f -- /lustre
This gives me a list of processes that I was then able to kill off. After that:
sudo umount /lustre
Followed by:
sudo mount -t lustre 192.168.1.11@tcp:/lustre /lustre
Which worked! Although I hadn’t yet updated the Lustre client, it was still able to handle the updated Lustre server. The other nodes that didn’t have active shells attached to them didn’t have any trouble with the change; I didn’t even have to remount them; the file system just showed up without any trouble.
Next step is to update the software on the compute nodes. Similar process except somewhat easier since we don’t have to deal with zfs. I still want to limit the install to the particular Linux kernel and the “Lustre-client” repo. In this case, I had to download the rpms from rpmfind:
https://rpmfind.net/linux/rpm2html/search.php?query=kernel%28×86-64%29&submit=Search+…&system=&arch=
I downloaded RPMs for kernel, kernel-debug-devel, kernel-headers, kernel-tools, and kernel-tools-libs. This time, I remembered to unmount /lustre first. Then I installed the new kernel modules:
Then, to install them:
sudo yum localinstall kernel-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-debug-devel-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-headers-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-tools-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-tools-libs-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm
Next, update the Lustre client:
sudo yum repo-pkgs lustre-client update kmod-lustre-client.x86_64 lustre-client.x86_64
Then update everything else, excluding the kernel stuff:
sudo yum update -x kernel,kernel-debug-devel,kernel-headers,kernel-tools,kernel-tools-libs
Finally, reboot and then remount Lustre:
sudo mount -t lustre 192.168.1.11@tcp:/lustre /lustre
Unlike with the Lustre server, I didn’t encounter any trouble with the reboot. The Lustre partition survived the update just fine, and I was able to successfully update all the rest of the installed software on the system.
Центр ментального здоровья Эмпатия это современное учреждение, созданное для оказания профессиональной помощи людям, испытывающим трудности в психоэмоциональной сфере. В небольшом отличии от обычных мед подходов, здесь акцент изготовлен на индивидуальном подходе к каждому клиенту, осознании его потребностей и чувств.
Основные направления работы
1. Психотерапия Центр делает отличное предложение разнообразные методы психотерапии, включая когнитивно-поведенческую терапию, гуманистическую и арт-терапию. Специалисты помогают клиентам разобраться в своих эмоциях, найти способы управляться с трудностями.
2. Консультации Тут работают бывалые психиатры и специалисты по психологии, готовые предоставить квалифицированные консультации по разным вопросам, связанным с ментальным здоровьем.
3. Групповая терапия Важной долею работы Центра являются группы помощи, где люди могут делиться своими переживаниями и получать поддержку от иных участников, а также от специалистов.
4. Программы профилактики Эмпатия также интенсивно занимается просвещением населения о важности ментального здоровья, проводя семинары и лекции.
Доступность услуг
Центр ментального здоровья Эмпатия стремится сделать свои услуги доступными для абсолютно всех. Клиенты могут записаться на прием как очно, так и на расстоянии. Использование детьми и подростками исполняется в отдельном формате, с учетом связанных с возрастом особенностей и потребностей http://kx2.net/space-uid-184158.html
Почему избирают Эмпатию
Среди причин, по которым клиенты выбирают именно этот центр, выделяют:
– Профессионализм служащих
– Комфортную и доброжелательную атмосферу
– Личный практикует своим клиентам
– Большой объем предоставляемых услуг
Заключение
Центр ментального здоровья Эмпатия это надежное место, в каком месте каждый найдет поддержку и помощь в тяжелую минутку. Ментальное здоровье всегда было важным нюансом общего благоденствия, и Центр активно способствует этому, творя неопасное пространство для общения и самораскрытия.
Центр ментального здоровья Эмпатия это современное учреждение, созданное для оказания профессиональной помощи людям, испытывающим трудности в психоэмоциональной сфере. В небольшом отличии от традиционных мед подходов, тут акцент сделан на личном подходе к каждому клиенту, осознании его потребностей и чувств.
Основные направления работы
1. Психотерапия Центр предлагает различные методы психотерапии, включая когнитивно-поведенческую терапию, гуманистическую и арт-терапию. Специалисты помогают клиентам разобраться в своих чувствах, найти методы справляться с трудностями.
2. Консультации Тут работают бывалые психиатры и психологи, готовые предоставить квалифицированные консультации по разным вопросам, связанным с ментальным здоровьем.
3. Групповая терапия Важной частью работы Центра являются группы поддержки, где люди могут делиться своими переживаниями и получать поддержку от других соучастников, а также от профессионалов.
4. Программки профилактики Эмпатия также активно занимается просвещением населения о значимости ментального здоровья, проводя семинары и лекции.
Доступность услуг
Центр ментального здоровья Эмпатия стремится сделать свои услуги доступными для абсолютно всех. Клиенты могут записаться на прием как очно, так и на расстоянии. Использование детьми и детьми исполняется в отдельном формате, учитывая связанных с возрастом особенностей и потребностей https://hastui.com/home.php?mod=space&uid=21440&do=profile
Почему выбирают Эмпатию
Среди причин, по которым клиенты избирают именно этот центр, выделяют:
– Профессионализм служащих
– Комфортную и доброжелательную атмосферу
– Личный практикует каждому клиенту
– Большой объем предоставляемых услуг
Заключение
Центр ментального здоровья Эмпатия это надежное место, в каком месте каждый найдет поддержку и помощь в трудную минутку. Ментальное здоровье всегда было главным нюансом общего благоденствия, и Центр активно содействует этому, создавая безопасное пространство для общения и самораскрытия.
Центр ментального здоровья Эмпатия это современное учреждение, созданное для оказания профессиональной поддержки людям, испытывающим трудности в психоэмоциональной сфере. В небольшом отличии от традиционных мед подходов, тут акцент изготовлен на личном подходе к каждому клиенту, понимании его потребностей и чувств.
Основные направления работы
1. Психотерапия Центр делает отличное предложение разнородные методы психотерапии, включая когнитивно-поведенческую терапию, гуманистическую и арт-терапию. Спецы помогают клиентам разобраться в своих эмоциях, отыскать способы управляться с трудностями.
2. Консультации Тут работают бывалые психиатры и специалисты по психологии, готовые предоставить квалифицированные консультации по разным вопросам, связанным с ментальным здоровьем.
3. Групповая терапия Главной частью работы Центра являются группы поддержки, где люди могут делиться своими переживаниями и получать поддержку от иных участников, но также от профессионалов.
4. Программы профилактики Эмпатия также активно занимается просвещением народонаселенья о важности ментального здоровья, проводя семинары и лекции.
Доступность услуг
Центр ментального здоровья Эмпатия устремляется сделать свои услуги доступными для абсолютно всех. Клиенты могут записаться на прием как очно, так и дистанционно. Работа с детьми и детьми исполняется в отдельном формате, учитывая связанных с возрастом особенностей и потребностей http://bbs.aldgame.com/home.php?mod=space&uid=129087
Почему выбирают Эмпатию
Среди обстоятельств, по которым клиенты выбирают именно этот центр, выделяют:
– Профессионализм служащих
– Уютную и доброжелательную атмосферу
– Личный подход к каждому клиенту
– Широкий спектр предоставляемых услуг
Заключение
Центр ментального здоровья Эмпатия это надежное место, где каждый может найти поддержку и помощь в тяжелую минуту. Ментальное здоровье всегда было принципиальным нюансом общего благоденствия, и Центр активно способствует этому, создавая безопасное место для общения и самораскрытия.
Центр ментального здоровья Эмпатия это современное учреждение, созданное для оказания профессиональной подмоги людям, испытывающим трудности в психоэмоциональной сфере. В небольшом отличии от обычных медицинских подходов, здесь акцент сделан на индивидуальном подходе к своим клиентам, понимании его потребностей и эмоций.
Основные направления работы
1. Психотерапия Центр делает отличное предложение разнообразные методы психотерапии, включая когнитивно-поведенческую терапию, гуманистическую и арт-терапию. Профессионалы помогают клиентам разобраться в своих эмоциях, отыскать способы справляться с трудностями.
2. Консультации Тут работают опытные психиатры и психологи, готовые предоставить квалифицированные консультации по различным вопросам, связанным с ментальным здоровьем.
3. Групповая терапия Важной частью работы Центра являются группы помощи, где люди могут делиться своими переживаниями и получать поддержку от иных участников, но также от специалистов.
4. Программки профилактики Эмпатия также активно занимается просвещением народонаселенья о значимости ментального здоровья, проводя семинары и лекции.
Доступность услуг
Центр ментального здоровья Эмпатия устремляется сделать свои услуги доступными для всех. Клиенты могут записаться на прием как очно, так и дистанционно. Работа с детьми и подростками осуществляется в отдельном формате, с учетом возрастных особенностей и потребностей http://harimuniform.co.kr/bbs/board.php?bo_table=free&wr_id=173455&&#c_340085
Почему выбирают Эмпатию
Среди причин, по которым клиенты избирают именно этот центр, выделяют:
– Профессионализм сотрудников
– Комфортную и доброжелательную атмосферу
– Индивидуальный практикует каждому клиенту
– Большой объем предоставляемых услуг
Заключение
Центр ментального здоровья Эмпатия это надежное место, где каждый может найти поддержку и помощь в трудную минуту. Ментальное здоровье всегда было главным нюансом общего благоденствия, и Центр активно содействует этому, создавая неопасное пространство для общения и самораскрытия.
Центр ментального здоровья Эмпатия это современное учреждение, созданное для оказания профессиональной поддержки людям, испытывающим трудности в психоэмоциональной сфере. В небольшом отличии от традиционных медицинских подходов, здесь акцент сделан на личном подходе к своим клиентам, осознании его потребностей и чувств.
Основные направления работы
1. Психотерапия Центр делает отличное предложение разнородные методы психотерапии, включая когнитивно-поведенческую терапию, гуманистическую и арт-терапию. Специалисты помогают клиентам разобраться в своих эмоциях, найти способы справляться с трудностями.
2. Консультации Тут работают опытные психиатры и психологи, готовые предоставить квалифицированные консультации по разным вопросам, связанным с ментальным здоровьем.
3. Групповая терапия Важной частью работы Центра являются группы помощи, где люди могут делиться своими переживаниями и получать поддержку от иных соучастников, а также от специалистов.
4. Программки профилактики Эмпатия также интенсивно занимается просвещением народонаселения о важности ментального здоровья, проводя семинары и лекции.
Доступность услуг
Центр ментального здоровья Эмпатия устремляется сделать свои услуги доступными для всех. Клиенты могут записаться на прием как очно, так и дистанционно. Работа с детьми и подростками исполняется в отдельном формате, учитывая возрастных особенностей и потребностей http://snatch39.free.fr/index.php?file=Members&op=detail&autor=ucumadury
Почему избирают Эмпатию
Среди обстоятельств, по которым клиенты выбирают именно этот центр, выделяют:
– Профессионализм служащих
– Комфортную и доброжелательную атмосферу
– Личный практикует каждому клиенту
– Широкий спектр предоставляемых услуг
Заключение
Центр ментального здоровья Эмпатия это надежное место, где каждый может найти поддержку и помощь в трудную минуту. Ментальное здоровье всегда было важным аспектом общего благополучия, и Центр активно способствует этому, творя безопасное место для общения и самораскрытия.
Центр ментального здоровья Эмпатия это современное учреждение, созданное для оказания профессиональной поддержки людям, испытывающим трудности в психоэмоциональной сфере. В отличие от обычных медицинских подходов, тут акцент сделан на личном подходе к своим клиентам, осознании его потребностей и чувств.
Основные направления работы
1. Психотерапия Центр делает отличное предложение разнообразные методы психотерапии, включая когнитивно-поведенческую терапию, гуманистическую и арт-терапию. Спецы помогают клиентам разобраться в своих чувствах, отыскать способы справляться с трудностями.
2. Консультации Тут работают опытные психиатры и специалисты по психологии, готовые предоставить квалифицированные консультации по разным вопросам, связанным с ментальным здоровьем.
3. Групповая терапия Главной долею работы Центра являются группы помощи, где люди могут делиться своими переживаниями и получать поддержку от иных участников, также от профессионалов.
4. Программки профилактики Эмпатия также интенсивно занимается просвещением народонаселенья о значимости ментального здоровья, проводя семинары и лекции.
Доступность услуг
Центр ментального здоровья Эмпатия стремится сделать свои услуги доступными для всех. Клиенты могут записаться на прием как очно, так и на расстоянии. Работа с детками и детьми исполняется в отдельном формате, учитывая возрастных особенностей и потребностей http://wiki.diamonds-crew.net/index.php?title=%D0%BF%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D1%87%D0%B5%D1%81%D0%BA%D0%B8%D0%B5%20%D0%B0%D1%82%D0%B0%D0%BA%D0%B8%20%D0%BB%D0%B5%D1%87%D0%B5%D0%BD%D0%B8%D0%B5
Почему избирают Эмпатию
Среди причин, по которым клиенты выбирают именно этот центр, выделяют:
– Профессионализм служащих
– Комфортную и доброжелательную атмосферу
– Индивидуальный практикует своим клиентам
– Широкий спектр предоставляемых услуг
Заключение
Центр ментального здоровья Эмпатия это надежное место, в каком месте каждый найдет поддержку и помощь в трудную минутку. Ментальное здоровье всегда было главным нюансом общего благоденствия, и Центр интенсивно содействует этому, творя безопасное пространство для общения и самораскрытия.