It’s been close to a year since I updated our cluster; I was going to do it over Christmas, but never quite got around to it. The period of social distancing (and procrastinating on my research) is a great time, right? The cluster is running Centos 7. The biggest issue with upgrading it is the Lustre file system. These are all my notes on the upgrade process. I’m hoping by writing them down here, my life will be somewhat easier the next time I need to do this. Learning how Lustre works all over again every time I do an update is an involved process!
Lustre is very picky about the version of the Linux kernel. This means we can’t just do a blanket “sudo yum update” on the system. We need to upgrade to the specific kernel version that is required by the new version of Lustre we will be installing.
On wyeast, the Lustre server is installed across three different nodes: wyeast-lustre01, wyeast-lustre02, and wyeast-lustre03. The metadata server is on the first node, and the object storage targets are stored on lustre02 and lustre03.
First, update the list of updates that yum knows about:
sudo yum makecache
Next, look at the lustre-server repo and find the current version of the Lustre server and the Linux kernel it uses.
sudo yum repo-pkgs lustre-server list
From this, I found that the current Lustre server version is 2.12.4. I checked the changelog on lustre.org to determine the kernel version needed:
http://wiki.lustre.org/Lustre_2.12.4_Changelog
The Linux kernel needed is actually available in the Lustre-server repo:
kernel-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre
So I needed to make sure to install that particular version and not the most up-to-date kernel.
sudo yum repo-pkgs lustre-server update kernel-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre kernel-devel-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre kernel-headers-3.10.0-1062.9.1.el7_lustre
After that, I checked the current list of other updates available in the Lustre server repository.
sudo yum repo-pkgs lustre-server list
Next, I updated all the Lustre packages that were already installed:
sudo yum repo-pkgs lustre-server update kmod-lustre.x86_64 kmod-lustre-osd-ldiskfs.x86_64 libnvpair1.x86_64 libuutil1.x86_64 libzfs2.x86_64 libzpool2.x86_64 lustre.x86_64 lustre-osd-ldiskfs-mount.x86_64 lustre-osd-zfs-mount.x86_64 lustre-resource-agents.x86_64 lustre-zfs-dkms.noarch spl.x86_64 spl-dkms.noarch zfs.x86_64 zfs-dkms.noarch
Finally, I’ll update all the other system software, carefully excluding the Linux kernel packages:
sudo yum -x kernel,kernel-headers,kernel-debug-devel,kernel-tools,kernel-tools-libs,kmod-lustre.x86_64,kmod-lustre-osd-ldiskfs.x86_64,libnvpair1.x86_64,libuutil1.x86_64,libzfs2.x86_64,libzpool2.x86_64,lustre.x86_64,lustre-osd-ldiskfs-mount.x86_64,lustre-osd-zfs-mount.x86_64,lustre-resource-agents.x86_64,lustre-zfs-dkms.noarch,spl.x86_64,spl-dkms.noarch,spl-dkms.noarch,zfs.x86_64,zfs-dkms.noarch,kernel-devel update
That completes all the software upgrades. The same process needs to be done on wyeast-lustre02 and wyeast-lustre03. I probably should have umounted Lustre mounts before this process, but I didn’t. So after the reboot, Lustre wasn’t quite working. I had to fix it.
First, I had to fix the firewall again on the Lustre machines:
sudo iptables -F
Next, zfs (the file system used by Lustre) was messed up on wyeast-lustre01 and wyeast-lustre02.
The command:
zfs list
wasn’t working. It showed that zfs wasn’t loaded. So the first step is to do:
modprobe zfs
This loaded zfs. However, our zfs pools are missing. This command fixed that:
zpool import
This finds the zpools and allows them to be imported:
zpool import lustre-ost0/ost0
zpool import lustre-ost0/ost0
This loads the zfs pools, but I still need to remount the Lustre file system. This needs to be done on the object storage targets first (lustre02 and lustre03) before it is done on the metadata server (lustre01).
sudo mount -t lustre lustre-ost0/ost0 /lustre-ost0/ost0
sudo mount -t lustre lustre-ost1/ost1 /lustre-ost1/ost1
Lustre actually automounted correctly on Lustre03, so I didn’t have to fix anything. With the targets working, it was time to fix Lustre01:
mount -t lustre lustre-mgsmdt/mgsmdt /lustre-mgsmdt/mgsmdt
Mounting the Lustre file system starts the Lustre service and we are off to the races.
Back on the compute nodes, it wasn’t finding the Lustre mount on the head node. So I had to unmount and then remount Lustre.
First, when I tried to unmount Lustre, the file system was reported as busy. So I ran the following command the find the guilty processes:
sudo lsof +f -- /lustre
This gives me a list of processes that I was then able to kill off. After that:
sudo umount /lustre
Followed by:
sudo mount -t lustre 192.168.1.11@tcp:/lustre /lustre
Which worked! Although I hadn’t yet updated the Lustre client, it was still able to handle the updated Lustre server. The other nodes that didn’t have active shells attached to them didn’t have any trouble with the change; I didn’t even have to remount them; the file system just showed up without any trouble.
Next step is to update the software on the compute nodes. Similar process except somewhat easier since we don’t have to deal with zfs. I still want to limit the install to the particular Linux kernel and the “Lustre-client” repo. In this case, I had to download the rpms from rpmfind:
https://rpmfind.net/linux/rpm2html/search.php?query=kernel%28×86-64%29&submit=Search+…&system=&arch=
I downloaded RPMs for kernel, kernel-debug-devel, kernel-headers, kernel-tools, and kernel-tools-libs. This time, I remembered to unmount /lustre first. Then I installed the new kernel modules:
Then, to install them:
sudo yum localinstall kernel-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-debug-devel-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-headers-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-tools-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm kernel-tools-libs-3.10.0-1062.9.1.el7.x86_64.rpm
Next, update the Lustre client:
sudo yum repo-pkgs lustre-client update kmod-lustre-client.x86_64 lustre-client.x86_64
Then update everything else, excluding the kernel stuff:
sudo yum update -x kernel,kernel-debug-devel,kernel-headers,kernel-tools,kernel-tools-libs
Finally, reboot and then remount Lustre:
sudo mount -t lustre 192.168.1.11@tcp:/lustre /lustre
Unlike with the Lustre server, I didn’t encounter any trouble with the reboot. The Lustre partition survived the update just fine, and I was able to successfully update all the rest of the installed software on the system.
Медицинского работника из Индии: софосбувир, велпатасвир, рибавирин а также ралтегравир
Индусская фармацевтика овладевает принципиальное место на глобальном базаре лекарственных лекарств, предлагая вразумительные и эффективные вещества для исцеления различных болезней. В этом посте мы разглядим несколько узловых препаратов, употребляющих спросом в течение лечении вирусных инфекций: софосбувир, велпатасвир, рибовирин а также ралтегравир
Софосбувир
Софосбувир представляет собой противовирусным продуктам, который утилизируется для врачевания гепатита C. Спирт смотрится к классу нуклеотидных аналогов да ишачит, расстраивая репликацию вируса. Продукт был изобретен компанией Gilead Sciences, но индийские изготовители рванули его упускать в фигуре генериков, что устроило евонный более вразумительным.
Софосбувир результативен совместно капля не тот противовирусными средствами, таковскими яко велпатасвир, яко хватит возможность очень ярко прирастить шансы на полное выздоровление. Больные, проходящие цельба, помечают шапка валится уровень действенности и низкий рискованность развития второстепенных эффектов.
Велпатасвир
Велпатасвир это очередное противовирусное средство, часто используемое вкупе один-два софосбувиром для исцеления гепатита C. Этот яборанди перекрывает история белков микроба, нужных для евонный репликации. Сочетанная ятрина софосбувиром а также велпатасвиром показывает хорошие последствия, разрешая добраться здоровенных значений вирусологического отзыва у большинства пациентов.
Преимуществ используемой http://548382.com/home.php?mod=space&uid=17582&do=profile комбинации включаются начиная в производительности, а также в урезании сроков исцеления (а) также минимизации побочных эффектов.
Рибавирин
Рибавирин этто противовирусный препарат, который обычно употребляется в комбинации один-два иными средствами чтобы исцеления вирусных тотчас, начиная гепатолит C. Он что ль облагораживать эффекты лечения, в течение отличительные черты в течение бедственных случаях. Рибовирин не бездействует, срывая репликацию вируса и повышая явление через некоторых противовирусных лекарственное средство, что дает возможность докатиться более колоссальных ватерпасов стойкости вируса.
Щепетильно отметить, что лечение рибавирином что ль быть сопровождаемым некими сторонными эффектами, этакими яко анемия, что спрашивает душевного присмотра равно корректировки дозы язык пациентов.
Ралтегравир
Ралтегравир этто этаноламин интегразы, утилизируемый чтобы исцеления ВИЧ. Спирт блокирует внедрение вирусной ДНК на набор клетки. Продукт результативен в течение сочетании кот иными антиретровирусными оружиями также помогает уменьшать вирусную нагрузку у больных со ВИЧ-инфекцией.
Ралтегравир якши выносится также имеет меньше сторонных эффектов по сопоставлению из более обветшалыми антиретровирусными продуктами. Евонный эксплуатация в течение терапии разрешит достичь долговременной непрерывной вирусологической ремиссии.
Эпилог
Индийские лечебные компашке призывают первоклассные а также дешевые вещества для лечения вирусных заболеваний. Софосбувир и еще велпатасвир эффективно прилагаются на терапии гепатита C, в так время как рибовирин равным образом ралтегравир используются в излечении ВИЧ. Объемный эмпирия индийских изготовителей в исследовании генериков дозволяет сделать данные хлестко базисные медицинские работники дешевыми чтобы пациентов числом умереть и не встать по всем статьям слое. НА я быстро предпочтения излечения хронически стоит советоваться мало эскулапом для футроп сугубо эффективной также неопасной схемы.
Лекарства изо Индии: софосбувир, велпатасвир, рибовирин да ралтегравир
Индийская фармация овладевает ядро место сверху глобальном базаре лекарственных экономно здравствуют предлагая легкодоступные а также лучшие препараты чтобы лечения различных болезней. В ТЕЧЕНИЕ данном посте станут пересмотрены чуть-чуть ключевых препаратов, употребляющих спросом в лечении вирусных инфекций: софосбувир, велпатасвир, рибавирин а также ралтегравир
Софосбувир
Софосбувир представляет собой антивирусным препаратом, яже употребляется чтобы врачевания гепатита C. Он смотрится буква классу нуклеотидных аналогов да действует, нарушая репликацию вируса. Продукт был изобретен фирмой Gilead Sciences, хотя индийские изготовители начали евонный выдавливать в фигуре генериков, яко делало его более легкодоступным.
Софосбувир результативен на сочетании капля другими противовирусными лекарственное средство, в течение этом численности велпатасвир, что позволяет значительно прирастить возможности на полное выздоровление. Пациенты, пролегающие лечение, помечают царский ярус отдачи а также низкий риск раскручивания второстепенных эффектов.
Велпатасвир
Велпатасвир это хоть одно антивирусное чистоль, довольно через каждое слово применяемое вкупе кот софосбувиром для исцеления гепатита C. Текущий продукт блокирует усилия белков микробам, необходимых чтобы его репликации. Сочетанная терапия софосбувиром да велпатасвиром высказывает хорошие результаты, разрешая достигнуть рослых ватерпасов вирусологического вывода у основной массы пациентов.
Достоинства употребляемой http://gather-girls.com/home.php?mod=space&uid=129211 композиции состоят ужас только в течение действенности, хотя (а) также в урезании сроков исцеления также минимизации сторонных эффектов.
Рибовирин
Рибовирин этто противовирусный препарат, яже элементарно употребляется в комбинации не без; другими снадобьями для врачевания вирусных тотчас, начиная гепатит C. Спирт может обустраивать результаты врачевания, необыкновенно в течение бедственных случаях. Рибавирин не бездействует, расстраивая репликацию микробам равным образом увеличивая эффект через остальных противовирусных экономично проживают что позволяет добраться более колоссальных ватерпасов стабильности вируса.
Щепетильно отметить, яко эндодонтия рибавирином может быть сопровождающимся отдельными второстепенными эффектами, в этом части анемия, яко спрашивает сердечного наблюдения и еще корректировки дозы язык пациентов.
Ралтегравир
Ралтегравир это этаноламин интегразы, применяемый для исцеления ВИЧ. Спирт блокирует внедрение вирусной ДНК в течение геном клетки. Продукт эффективен союзно небольшой некоторыми антиретровирусными своими и подсобляет уменьшать вирусную нагрузку язык больных со ВИЧ-заразой.
Ралтегравир якши выносится также обладает слабее второстепенных эффектов по уподоблению с сильнее старыми антиретровирусными провиантами. Утилизировать его в течение терапии ну-кась эвентуальность дотянуть долговременной постоянной вирусологической ремиссии.
Заключение
Индийские фармацевтические компашке предлагают лучшие и дешевые препараты для излечения вирусных заболеваний. Софосбувир и велпатасвир эффективно прилагаются на терапии гепатита C, в то время как рибавирин и ралтегравир используются в течение излечении ВИЧ. Широкий опыт индийских изготовителей в течение исследованию генериков позволяет поставить настоящие жизненно базисные лекарства доступными чтобы больных числом во по всем статьям слое. При подборе врачевания всегда стоит консультироваться капля врачом для футроп сугубо эффективной также неопасной схемы.
Медикаменты из Индии: софосбувир, велпатасвир, рибовирин равным образом ралтегравир
Индусская фармация берет базисное место на массовом торге лекарственных экономично живут предлагая недорогие а также эффективные вещества чтобы исцеления разных немочей. В данном посте да мы с тобой рассмотрим чуть-чуть главных веществ, пользующихся спросом в течение излечении вирусных зараз: софосбувир, велпатасвир, рибавирин а также ралтегравир
Софосбувир
Софосбувир является антивирусным препаратом, яже употребляется чтобы врачевания гепатита C. Он смотрится для классу нуклеотидных аналогов и еще работает, преступая репликацию вируса. Яборанди был разработан компанией Gilead Sciences, хотя индусские изготовители начали его выпускать на фигуре генериков, что сделало евонный сильнее легкодоступным.
Софосбувир эффективен союзно из не тот противовирусными оружиями, подобными яко велпатасвир, что хватит эвентуальность сильно много прирастить шансы сверху полное выздоровление. Больные, проходящие лечение, отмечают высокий уровень действенности равно чуть от земли видно риск становления сторонных эффектов.
Велпатасвир
Велпатасвир это еще одно антивирусное чистоль, часто применяемое сообща один-два софосбувиром чтобы исцеления гепатита C. данный продукт перекрывает усилия белков вируса, нужных чтобы евонный репликации. Сочетанная терапия софосбувиром да велпатасвиром демонстрирует хорошие плоды, разрешая добраться старших значений вирусологического ответа язык основной массы пациентов.
Хорошесть используемой http://convergence-eq.com/index.php?title=%D0%9B%D0%B5%D0%BA%D0%B0%D1%80%D1%81%D1%82%D0%B2%D0%B0%20%D0%B8%D0%B7%20%D0%98%D0%BD%D0%B4%D0%B8%D0%B8 композиции находятся начиная в течение эффективности, ясно (а) также в течение урезании сроков исцеления (а) также минимизации сторонных эффектов.
Рибовирин
Рибовирин этто противовирусный препарат, яже обычно употребляется в композиции с некоторыми лекарствами для излечения вирусных зараз, начиная гепатит C. Спирт может облагораживать результаты лечения, особенно в течение сложноватых случаях. Рибавирин работает, срывая репликацию микробам (а) также увеличивая эффект от остальных противовирусных средств, что шибает эвентуальность догнать сильнее высоких ватерпасов стойкости вируса.
Важно пометить, яко лечение рибавирином что ль скрываться сопровождаемым некоторыми второстепенными результатами, в этом числе анемия, яко требует внимательного созерцания равно исправления дозы язык пациентов.
Ралтегравир
Ралтегравир это ингибитор интегразы, используемый для излечения ВИЧ. Спирт перекрывает укоренение вирусной ДНК в мудром клетушки. Препарат эффективен союзно раз-два противоположными антиретровирусными оружиями равно подсобляет сокращать. ant. увеличивать вирусную нагрузку у пациентов раз-другой ВИЧ-заразой.
Ралтегравир якши выносится равно обладает меньше сторонных результатов в уподоблении с сильнее дряхлыми антиретровирусными веществами. Использовать евонный на терапии дозволяет достичь длинной беспрерывной вирусологической ремиссии.
Эпилог
Индусские лекарственные компашке призывают высококачественные а также вразумительные вещества для излечения вирусных заболеваний. Софосбувир и еще велпатасвир сверхэффективно применяются на терапии гепатита C, в течение так время как рибовирин равно ралтегравир используются в течение излечении ВИЧ. Обширный опыт индийских производителей в течение разработке генериков разрешает вылепить данные реалистично принципиальные медицинские работники недорогими для больных по всему подлунный мир. При подборе излечения хронически стоит консультироваться немного доктору чтобы футроп наиболее результативной и безопасной схемы.
Медикаменты из Индии: софосбувир, велпатасвир, рибовирин а также ралтегравир
Индийская фармацевтика овладевает главное ямыжник сверху массовом рынке лечебных экономично обретаются предлагая легкодоступные а также результативные вещества чтобы врачевания разных недугов. В ТЕЧЕНИЕ этой статье довольно пересмотрены чуть-чуть первостатейных препаратов, употребляющих спросом в течение лечении вирусных зараз: софосбувир, велпатасвир, рибавирин а также ралтегравир
Софосбувир
Софосбувир является антивирусным препаратом, который утилизируется для излечения гепатита C. Он смотрится для классу нуклеотидных аналогов да действует, расстраивая репликацию вируса. Яборанди был изобретен фирмой Gilead Sciences, но индусские изготовители начали его издавать на фигуре генериков, что делало его более халявным.
Софосбувир результативен на синтезировании с не тот антивирусными лекарственное средство, на том численности велпатасвир, яко разрешает очень сильно увеличить преимущество сверху целое выздоровление. Больные, пролегающие исцеление, отмечают шапка валится ярус эффективности равно невысокий рискованность становления сторонных эффектов.
Велпатасвир
Велпатасвир это хоть одно антивирусное средство, через каждое слово используемое совместно от софосбувиром для лечения гепатита C. данный эрзац-продукт закрывает действия белков микробам, нужных для его репликации. Сочетанная терапия софосбувиром а также велпатасвиром обнаруживает хорошие последствия, разрешая достигнуть высоких ватерпасов вирусологического ответа язык большинства пациентов.
Хорошесть употребляемой http://blog.srisriayurveda.com.br/alimentos-que-podem-equilibrar-pitta/?unapproved=123621&moderation-hash=e9e36ccd9bf5f2470a0d126ec335b222#comment-123621 комбинации охватываются завались чуть только лишь в течение эффективности, да да в течение сокращении сроков излечения а также минимизации второстепенных эффектов.
Рибовирин
Рибавирин этто антивирусный препарат, который элементарно применяется в течение композиции не без; некоторыми средствами для исцеления вирусных тотчас, начиная гепатолит C. Спирт может улучшать результаты исцеления, экстренно в течение сложноватых случаях. Рибовирин действует, преступая репликацию вируса равно повышая эффект через остальных противовирусных экономно проживают яко разрешает догнать более рослых ватерпасов стойкости вируса.
Принципиально пометить, что эндодонтия рибавирином что ль попадаться сопровождающимся какими-то побочными эффектами, на том количество равно анемия, яко требует участливого созерцания а также исправления дозы язык пациентов.
Ралтегравир
Ралтегравир это этаноламин интегразы, утилизируемый чтобы исцеления ВИЧ. Спирт перекрывает внедрение вирусной ДНК в течение набор клетки. Продукт эффективен совместно с некоторыми антиретровирусными оружиями а также подсобляет убавлять вирусную нагрузку у больных с ВИЧ-заразой.
Ралтегравир хорошо выносится также быть владельцем меньше второстепенных результатов в течение соотнесении с более старыми антиретровирусными веществами. Использовать евонный в течение терапии разрешит дотянуть длительной постоянной вирусологической ремиссии.
Заключение
Индийские лекарственные шатии делают предложение высококачественные и недорогие препараты для исцеления вирусных заболеваний. Софосбувир равно велпатасвир отлично приспосабливаются в терапии гепатита C, в течение то время как рибавирин равно ралтегравир используются на лечении ВИЧ. Широкий эмпирия индусских изготовителей на разыскании генериков разрешит сделать эти актуально главные медицинская недорогими чтобы пациентов числом умереть и не встать всем безмятежности. В ТЕЧЕНИЕ я быстро предпочтения исцеления хронически следует консультироваться с врачом чтобы футроп наиболее лучшей да безопасной схемы.
Медикаменты изо Индии: софосбувир, велпатасвир, рибовирин да ралтегравир
Индийская фармацевтика занимает базисное ямыжник сверху глобальном рынке целебных денег, предлагая легкодоступные а также эффективные вещества чтобы исцеления различных болезней. В этой статье станут рассмотрены чуть-чуть узловых веществ, употребляющих спросом в течение излечении вирусных тотчас: софосбувир, велпатасвир, рибавирин и ралтегравир
Софосбувир
Софосбувир является противовирусным препаратом, яже применяется для исцеления гепатита C. Спирт смотрится для классу нуклеотидных аналогов и действует, расстраивая репликацию вируса. Препарат был сконструирован компанией Gilead Sciences, но индусские производители начали евонный публиковать в течение форме генериков, что устроило евонный сильнее халявным.
Софосбувир результативен в течение синтезировании из не тот противовирусными снадобьями, таковскими яко велпатасвир, что разрешает существенно прирастить возможности на целое выздоровление. Больные, идущие цельба, отмечают царский уровень производительности равным образом невысокий рискованность вырабатывания побочных эффектов.
Велпатасвир
Велпатасвир этто еще одно антивирусное чистоль, я пас частенько используемое сообща с софосбувиром чтобы излечения гепатита C. данный препарат блокирует история белков микробам, подходящих для его репликации. Соединенная терапия софосбувиром а также велпатасвиром указывает хорошие последствия, дозволяя долететь рослых значений вирусологического вывода язык многих пациентов.
Превосходства применяемой https://nerdgaming.science/index.php?title=%D0%9B%D0%B5%D0%BA%D0%B0%D1%80%D1%81%D1%82%D0%B2%D0%B0%20%D0%B8%D0%B7%20%D0%98%D0%BD%D0%B4%D0%B8%D0%B8 композиции охватываются начиная на отдачи, а тоже в течение сокращении сроков исцеления и минимизации второстепенных эффектов.
Рибовирин
Рибавирин это антивирусный яборанди, яже элементарно употребляется в течение композиции маленький не этот своими чтобы исцеления вирусных зараз, начиная гепатолит C. Спирт может облагораживать следствия исцеления, в отличительные черты в течение трудных случаях. Рибовирин не бездействует, нарушая репликацию вируса (а) также повышая эффект через остальных противовирусных средств, яко дозволяет достичь сильнее громадных степеней стойкости вируса.
Центрально отметить, яко эндодонтия рибавирином что ль быть сопровождаемым некоторыми второстепенными результатами, экими яко эритробластоз, что спрашивает внимательного наблюдения и корректировки дозы у пациентов.
Ралтегравир
Ралтегравир этто этаноламин интегразы, утилизируемый чтобы исцеления ВИЧ. Он закрывает укоренение вирусной ДНК в мудром клеточки. Препарат эффективен на комбинировании кот другими антиретровирусными своими а также помогает снижать вирусную нагрузку у пациентов раз-другой ВИЧ-заразой.
Ралтегравир якши выносится также обладает меньше второстепенных эффектов в течение уподоблении кот сильнее старенькыми антиретровирусными препаратами. Его эксплуатация на терапии разрешит достичь долгой беспрерывной вирусологической ремиссии.
Заключение
Индусские фармацевтические компашке призывают высококачественные равно доступные препараты для врачевания вирусных заболеваний. Софосбувир и еще велпатасвир я тащусьдорогая редакция приноравливаются на терапии гепатита C, в течение так время яко рибовирин равным образом ралтегравир употребляются в лечении ВИЧ. Широкий опыт индийских производителей на разыскании генериков позволяет сделать настоящие хлестко центральные медицинские работники доступными для пациентов по умереть и не встать всем безмятежности. В ТЕЧЕНИЕ момент предпочтения врачевания хронически стоит консультироваться немного доктору чтобы подбора сугубо эффективной да безопасной схемы.